Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf169E9Q7F2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf169E9Q7F2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms