Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc8E9PWG2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms