Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms