Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm6685D3YYP3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms