Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm4787B2RUD9 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm4787B2RUD9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm4787B2RUD9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm4787B2RUD9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm4787B2RUD9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm4787B2RUD9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm4787B2RUD9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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