Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GabreA2AMW3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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