Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Prdm16A2A935 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm16A2A935 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms