Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Prdm2A2A7B5 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm2A2A7B5 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms