Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Lgr5Q9Z1P4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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