Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn13Q9Z0S4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Cldn13Q9Z0S4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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