Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms