Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Col5a3Q9JLI2 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col5a3Q9JLI2 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms