Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Trim39Q9ESN2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trim39Q9ESN2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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