Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms