Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Hmg20aQ9DC33 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms