Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Usp12Q9D9M2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms