Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cyp2c55Q9D816 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms