Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Snx20Q9D2Y5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms