Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pfdn1Q9CWM4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pfdn1Q9CWM4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pfdn1Q9CWM4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn1Q9CWM4 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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