Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atxn3Q9CVD2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atxn3Q9CVD2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atxn3Q9CVD2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atxn3Q9CVD2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atxn3Q9CVD2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn3Q9CVD2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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