Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms