Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
CsprsQ99388 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275.1 ms