Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms