Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnka2ipQ8CH19 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Csnka2ipQ8CH19 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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