Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Usp20Q8C6M1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp20Q8C6M1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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