Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms