Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssuh2Q8C3L1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssuh2Q8C3L1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms