Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr449-201ENSMUST00000050729 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trim35Q8C006 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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