Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp38Q8BW70 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp38Q8BW70 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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