Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ubash3bQ8BGG7 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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