Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.5Q85ZW7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms