Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Amigo1Q80ZD8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms