Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NanogQ80Z64 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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