Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms