Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Eci3Q78JN3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Eci3Q78JN3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Eci3Q78JN3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Eci3Q78JN3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Eci3Q78JN3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Eci3Q78JN3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Eci3Q78JN3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Eci3Q78JN3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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