Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Atg16l2Q6KAU8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms