Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pkp4Q68FH0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms