Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctnna3Q65CL1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms