Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms