Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cd47Q61735 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cd47Q61735 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cd47Q61735 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cd47Q61735 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cd47Q61735 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cd47Q61735 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cd47Q61735 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cd47Q61735 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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