Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PcolceQ61398 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PcolceQ61398 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PcolceQ61398 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PcolceQ61398 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PcolceQ61398 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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