Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klf3Q60980 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms