Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TefmQ5SSK3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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