Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms