Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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