Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem253Q3UNB8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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