Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
InipQ3TXT3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms