Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp39Q3TIX9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Usp39Q3TIX9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms