Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trim71Q1PSW8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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