Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rpusd2Q149F1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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